Sau gần 2 năm cải tạo nâng cấp, tuyến đường cho phép khai thác 23 đôi tàu hoạt động trên đoạn Việt Trì – Yên Bái, 33 đôi tàu/ngày đêm trên đoạn Yên Bái – Phố Lu, xóa bỏ hầu hết các điểm xung yếu gây mất an toàn và rút ngắn thêm 40 phút chạy tàu từ Hà Nội đến Lào Cai.
Ngoài việc rút ngắn 1 giờ tàu chạy, công suất vận tải hành khách và hàng hóa của tuyến cũng được nâng lên gấp đôi, lên thành 33 đôi tàu mỗi ngày đêm.
Trong giai đoạn 2 của dự án nâng cấp tuyến Yên Viên - Lào Cai được triển khai năm 2016, dự kiến thời gian chạy tàu sẽ còn tiếp tục được rút ngắn thêm 1 tiếng đồng hồ nữa.