Để xét tuyển vào các lớp chuyên các thí sinh phải hoàn thành hết các môn thi của mình theo quy định. Các bài dự thi vào trường chuyên phải đạt điểm lớn hơn 2,0.
Theo đó, năm nay điểm xét tuyển lớp 10 chuyên Toán từ 29,600 trở lên, số chỉ tiêu là 70 học sinh; chuyên Vật lý điểm xét là từ 23,650 trở lên, tổng số chỉ tiêu là 35 học sinh; chuyên Hóa học điểm xét tuyển từ 28,600 điểm trở lên, chỉ tiêu là 70 học sinh; điểm xét tuyển chuyên Sinh học là 30,250 điểm trở lên, chỉ tiêu học sinh 35; điểm chuyên Tin học là 23,250 trở lên, chỉ tiêu 35 học sinh; điểm xét tuyển chuyên Ngữ văn là từ 30,750 điểm, số chỉ tiêu là 35; chuyên Lịch sử điểm xét tuyển từ 24,050, số chỉ tiêu là 18 học sinh; chuyên Địa lý từ 25,350 trở lên, chỉ tiêu là 17 học sinh; điểm để xét cho chuyên tiếng Anh 34,600, số chỉ tiêu là 70 học sinh.
Còn đối với các học sinh dự thi vào các lớp hệ không chuyên của trường các bài thi phải đạt từ 2,00 điểm trở lên. Tổng số điểm xét tuyển phải đạt từ 22,750 trở lên, ngoài ra thí sinh đạt điểm môn chuyên từ 5,75 trở lên.
So với điểm chuẩn đầu vào năm học 2015 – 2016, năm học 2016 – 2017 điểm chuẩn đầu vào lớp 10 của trường tăng nhẹ ở phần lớn các lớp.
Năm học 2016 – 2017, Trường THPT chuyên Hùng Vương sẽ tuyển sinh lớp 10 là 13 lớp. Trong đó hệ chuyên tuyển 11 lớp với 385 học sinh, hệ không chuyên tuyển 2 lớp với 80 học sinh.