Theo cáo trạng, Nguyễn Duy Hiển làm việc tại Phòng Tài chính – Kế toán của Bệnh viện Phan Thiết (sau đổi tên là TTYT Phan Thiết) từ đầu năm 2010. Tiếp đó, đến đầu năm 2015, Hiển được bổ nhiệm Phó Trưởng phòng phụ trách Phòng Tài chính – Kế toán. Đến tháng 5/2016 thì được bổ nhiệm làm Trưởng phòng.
Nhiệm vụ của Hiển được giao là quản lý thanh toán lương cho cán bộ, công viên chức Bệnh viện Phan Thiết và các khoản thu của đơn vị. Trong thời gian từ tháng 12/2013 đến tháng 6/2018, lợi dụng chức trách, nhiệm vụ được giao và sự thiếu kiểm tra, giám sát của lãnh đạo Bệnh viện Phan Thiết, Nguyễn Duy Hiển đã lập khống bảng lương, các khoản phụ cấp, chế độ ốm đau của đơn vị để chiếm đoạt hơn 5,4 tỷ đồng.
Theo quy trình, hàng tháng Phòng Tổ chức – Hành chính của TTYT sẽ kiểm tra bảng chấm công và lên bảng lương cho người trong đơn vị. Sau khi nhận bảng lương dưới dạng file Excel, Hiển lập ra một bảng lương mới, nâng khống hệ số phụ cấp ưu đãi nghề của bảng lương để trình lãnh đạo ký duyệt.
Với thủ đoạn trên, từ tháng 12/2013 đến tháng 3/2018, Nguyễn Duy Hiển nâng khống 47 bộ chứng từ thanh toán lương để chiếm đoạt gần 4 tỷ đồng. Cũng với chiêu thức tương tự, Hiển cũng lập 13 bộ chứng từ kê khống số người được hưởng chế độ ốm đau, thai sản để chiếm đoạt hơn 1,5 tỷ đồng.
Ngày 13/5/2019, Nguyễn Duy Hiển bị khởi tố, bắt giam khi đã chuyển công tác từ TTYT Phan Thiết sang chuyên viên Sở Y tế Bình Thuận. Tại cơ quan điều tra, Hiển khai thực hiện hành vi trên là do có chỉ đạo của lãnh đạo Bệnh viện TP Phan Thiết để lấy tiền chi các khoản không có hóa đơn, chứng từ của đơn vị.
Số tiền nâng khống lương và chế độ ốm đau, thai sản Hiển đã sử dụng một phần để chi tiếp khách, phong bì cho các đoàn thanh tra… Tuy nhiên Hiển không cung cấp được chứng cứ cho lời khai này.
Hiển bị truy tố về tội tham ô tài sản theo Khoản 4, Điều 353, Bộ luật Hình sự khung hình phạt tù 20 năm, chung thân hoặc tử hình. Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh Bình Thuận cũng đã ra quyết định khởi tố vụ án hình sự về tội thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng xảy ra tại TTYT TP Phan Thiết để điều tra.
Quá trình điều tra vụ án đã xác định có hành vi thiếu trách nhiệm của các cá nhân khác công tác tại TTYT Phan Thiết và Kho bạc Nhà nước tỉnh Bình Thuận.
Trong tháng 6/2020, Sở Y tế Bình Thuận đã công bố các quyết định thi hành kỷ luật cách chức ông Nguyễn Trung Hà và ông Ngô Giang Vũ là Giám đốc, Phó Giám đốc Trung tâm Y tế TP Phan Thiết.
Ngoài ra, liên quan đến sai phạm tại trung tâm này còn có trách nhiệm của 3 người khác, gồm: Ông Nguyễn Quang Thời (nguyên Giám đốc Trung tâm Y tế TP Phan Thiết, nay là Phó Giám đốc Bệnh viện Đa khoa Bình Thuận), bà Nguyễn Thị Bích Anh (nguyên Phó Giám đốc Bệnh viện TP Phan Thiết) và bà Trần Thị Thu Thảo (Trưởng phòng Tài chính Kế toán).
Quá trình điều tra, gia đình Hiển đã nộp lại số tiền hơn 380 triệu đồng để khắc phục. Ông Nguyễn Quang Thời nộp 900 triệu đồng.
Còn ông Nguyễn Trung Hà nộp khắc phục số tiền 1 tỷ đồng, ông Ngô Giang Vũ nộp 1,8 tỷ, bà Trần Thị Thu Thảo nộp 1 tỷ 350 triệu đồng. Tổng số tiền các cá nhân đã nộp để khắc phục hậu quả hơn 5,4 tỷ đồng, hậu quả vật chất trong vụ án được khắc phục.