Việc quản lý và sử dụng số kinh phí bổ sung thực hiện theo quy định hiện hành.
Đối với việc bổ sung kinh phí để mua sắm trang thiết bị cho các đơn vị khoa học và công nghệ trực thuộc và thực hiện các nhiệm vụ khoa học và công nghệ của các Bộ, cơ quan trung ương: Bộ Tài chính và Bộ Khoa học công nghệ xem xét, rà soát và bố trí trong dự toán chi sự nghiệp của các Bộ, cơ quan trung ương và các địa phương từ năm 2015 bảo đảm đúng mục đích, hiệu quả, tiết kiệm trình cấp thẩm quyền quyết định theo quy định của Luật ngân sách nhà nước và các văn bản hướng dẫn thực hiện.
Bộ Khoa học và Công nghệ và các cơ quan được phân bổ kinh phí chịu trách nhiệm quyết định triển khai thực hiện các đề tài, dự án, nhiệm vụ khoa học và công nghệ đã được phê duyệt phù hợp với số kinh phí được bổ sung, bảo đảm đúng chính sách, chế độ quy định.