Trung tâm có tư cách pháp nhân, có tài khoản và con dấu riêng, hoạt động theo quy định của nhà nước đối với đơn vị sự nghiệp công lập; trụ sở tại 41 Lê Duẩn, thành phố Đà Nẵng.
Đồng thời, có cơ cấu tổ chức, chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn, tài chính và hoạt động theo quy định tại Thông tư số 61/2012/TT-BGDĐT quy định điều kiện thành lập và giải thể, nhiệm vụ, quyền hạn của tổ chức kiểm định chất lượng giáo dục.
Trước đó, Bộ GD&ĐT cũng đã quyết định hai Trung tâm kiểm định chất lượng giáo dục tại ĐHQG Hà Nội và ĐHQG TP HCM.
