Theo cáo trạng của Viện KSND, Trường TC Văn Hiến được thành lập từ năm 2009 (thuộc Cty CP Minh Tân). Từ năm 2009 đến năm 2013 mức thu học phí và các khoản thu khác của trường Văn Hiến là 56.000.721.000 đồng, tổng doanh thu đã được đưa vào sổ sách kê khai báo cáo thuế là 38.430.755.753 đồng, do đó phần doanh thu bỏ ngoài sổ sách không kê khai báo cáo thuế là 17.569.965.247 đồng.
Ngày 15/1/2015 Cơ quan CSĐT (Công an TP Thanh Hóa) ra quyết định trưng cầu giám định số 125/CSĐT trưng cầu Cục Thuế tỉnh Thanh Hóa giám định với số tiền trốn thuế trên.
Ngày 16/1/2015, Cục Thuế tỉnh Thanh Hóa đã kết luận giám định với doanh thu bỏ ngoài sổ sách 17.569.965.247 đồng là thu nhập chịu thuế, do đó số tiền trốn thuế của Trường TC Y dược Văn Hiến là 1.786.893.824,7 đồng.
Tuy nhiên theo Luật Doanh nghiệp bù trừ với số lỗ năm 2012 số tiền 215.689.861 đồng, còn lại thu nhập chưa kê khai nộp thế là 17.354.275.386 đồng, do vậy số trốn thuế còn lại là 1.735.427.538 đồng.
Với hành vi trên, Nguyễn Đức Tâm đã bị tuyên phạt 3 năm 6 tháng tù giam, truy thu 1,7 tỷ đồng và phạt 1,7 tỷ đồng vào ngân sách nhà nước.
Trước đó, báo Giáo dục và Thời đại đã đưa tin, ngày 18/9/2015, ông Nguyễn Đức Tâm cũng đã bị TAND tỉnh Thanh Hóa tuyên phạt 9 tháng tù giam về tội “làm giả con dấu, tài liệu của cơ quan, tổ chức”. Cụ thể là giả con chữ ký, con dấu của Hiệu trưởng nhà trường, Phó Chủ tịch UBND tỉnh Thanh Hóa và Bộ GD&ĐT.
