Hội đồng khoa học TP có chức năng đề xuất và góp ý kiến áp dụng các thành tựu tiến bộ khoa học, kỹ thuật vào sản xuất và đời sống, việc thực hiện các dự án đầu tư phát triển lớn ở TP; tư vấn về phương hướng, biện pháp đào tạo, bồi dưỡng và sử dựng đội ngũ cán bộ khoa học, kỹ thuật và công nhân có tay nghề cao.
Ngoài ra, Hội đồng còn tư vấn việc triển khai thực hiện đường lối, chủ trương, Nghị quyết của Đảng và chính sách, pháp luật của Nhà nước; Tư vấn xây dựng, hoạch định và thực hiện các chỉ đạo của Thành ủy; tham gia xây dựng các dự thảo chiến lược, chương trình, kế hoạch lãnh đạo, điều hành của UBND TP trong lĩnh vực khoa học và công nghệ, khoa học xã hội…
