Cụ thể, 8 đội xuất sắc nhất các bảng khối THCS gồm: Bảng A, Nhất: Nghệ An, Nhì: Đăk Lăk; Bảng B, Nhất: Đồng Nai, Nhì: TP Hồ Chí Minh; Bảng C, Nhất: Bình Phước, Nhì: Hà Nội; Bảng D, Nhất: An Giang, Nhì: Hải Phòng.
Khối tiểu học gồm: Bảng A, Nhất: Thanh Hóa, Nhì: Cần Thơ; Bảng B, Nhất: TP Hồ Chí Minh, Nhì: Bình Phước; Bảng C, Nhất: Tuyên Quang, Nhì: Phú Yên; Bảng D, Nhất: Hải Dương, Nhì: Nghệ An.
Ngày 18/7, 8 trận đấu tứ kết sẽ diễn ra với 4 trận khối THCS gồm: Nghệ An – TP Hồ Chí Minh, Bình Phước – Hải Phòng, Đồng Nai – Đăk Lăk, An Giang – Hà Nội; 4 trận khối tiểu học: Thanh Hóa – Bình Phước, Tuyên Quang – Nghệ An, TP Hồ Chí Minh – Cần Thơ, Hải Dương – Phú Yên. Các đội giành chiến thắng trong trận tứ kết sẽ vào tranh tài ở vòng bán kết để giành vé vào chung kết tranh ngôi vô địch giải bóng đá Hội khỏe Phù Đổng học sinh Tiểu học và Trung học cơ sở (THCS) toàn quốc Cúp Milo lần XV năm 2017.