Tổ chức 4 Hội đồng thi
Theo đó, thời gian thi vào 14/9/2016, tại 4 Hội đồng coi thi:
Hội đồng số 1, đặt tại trường THPT Chu Văn An thi các môn: Toán, Vật lý, Hoá học, Sinh học, Ngữ văn cho các trường thuộc các quận, huyện: Hoàn Kiếm, Ba Đình, Hai Bà Trưng, Đống Đa, Thanh Xuân, Long Biên, Gia Lâm, Đông Anh, Sóc Sơn, Hoàng Mai, Thanh Trì, Cầu Giấy, Nam Từ Liêm, Bắc Từ Liêm, Tây Hồ, Mê Linh; môn Tin học cho đối tượng là học sinh trường THPT chuyên Hà Nội - Amsterdam và THPT Chu Văn An.
Hội đồng số 2, đặt tại trường THPT Phan Đình Phùng thi các môn: Lịch sử, Địa lý, Tiếng Anh, Tiếng Pháp, Tin học cho các trường thuộc các quận, huyện: Hoàn Kiếm, Ba Đình, Hai Bà Trưng, Đống Đa,Thanh Xuân, Long Biên, Gia Lâm, Đông Anh, Sóc Sơn, Hoàng Mai, Thanh Trì, Cầu Giấy, Nam Từ Liêm, Bắc Từ Liêm, Tây Hồ, Mê Linh.
Hội đồng số 3, đặt tại trường THPT chuyên Nguyễn Huệ thi tất cả các môn cho các trường thuộc các quận, huyện: Hà Đông, Hoài Đức, Thanh Oai, Chương Mỹ, Ứng Hoà, Mỹ Đức, Thường Tín, Phú Xuyên, Quốc Oai.
Hội đồng số 4, đặt tại trường THPT Sơn Tây thi tất cả các môn cho các trường thuộc các huyện, thị xã: Sơn Tây, Ba Vì, Đan Phượng, Phúc Thọ, Thạch Thất.
Quy định về thí sinh dự thi
Mỗi học sinh chỉ được dự thi một môn. Trường có dưới 8 lớp 12 được cử 1 học sinh/môn; có từ 9 đến 14 lớp 12 được cử 2 học sinh/môn; từ 15 lớp 12 trở lên được cử 3 học sinh/môn.
Các trường THPT chuyên: Hà Nội - Amsterdam; Nguyễn Huệ được cử 25 học sinh dự thi /mỗi môn thi.
Trường THPT Chu Văn An, THPT Sơn Tây có lớp chuyên được cử 15 học sinh dự thi/ mỗi môn thi.
Thi chọn đội tuyển học sinh giỏi dự thi học sinh giỏi quốc gia
Thi chọn đội tuyển học sinh giỏi dự thi học sinh giỏi quốc gia vào 30/9/2016, tổ chức tại 2 Hội đồng coi thi:
Hội đồng số 1, đặt tại trường THPT Chu Văn An thi các môn: Toán, Vật lý, Hoá học, Sinh học, Ngữ văn, Tin học.
Hội đồng số 2 đặt tại trường THPT chuyên Hà Nội - Amsterdam thi các môn: Lịch sử, Địa lý, Tiếng Anh, Tiếng Nga, Tiếng Pháp, Tiếng Trung.
Hình thức thi:
Các môn Vật lý, Hóa học và Sinh học trong đề thi có thêm phần lý thuyết thí nghiệm, thực hành, thực nghiệm.
Các môn Tiếng Anh, Tiếng Nga, Tiếng Pháp, Tiếng Trung có thêm phần thi nói vào chiều 30/9/2016 tại trường THPT chuyên Hà Nội - Amsterdam.
Các môn Toán, Tin học , Ngữ văn, Lịch sử, Địa lý không thay đổi.