Nguyên nhân của tình trạng này là do nạn khai thác gỗ và cháy rừng. Đây là ảnh hưởng của biến đổi khí hậu do con người gây ra.
Đối với khoảng 3/4 khu rừng, khả năng phục hồi sau sự xáo trộn đã giảm dần kể từ đầu những năm 2000. Các nhà khoa học coi đây là một dấu hiệu cảnh báo về khả năng phục hồi của rừng Amazon.