Sở Y tế giao Trung tâm Kiểm soát bệnh tật Hà Nội làm đầu mối phối hợp với Cảng vụ hàng không và sân bay Quốc tế Nội Bài để tiếp nhận thông tin hành khách về Hà Nội và thông tin cho Bộ Tư lệnh Thủ đô, UBND các quận, huyện, thị xã (qua Trung tâm Y tế) để quản lý, theo dõi và áp dụng các biện pháp cách ly y tế theo quy định về phòng chống dịch COVID-19 theo từng loại đối tượng và chuyến bay.
Thực hiện nhiệm vụ kiểm dịch y tế đối với mọi hành khách và phối hợp với Cảng hàng không Quốc tế Nội Bài để phân luồng, phân loại hành khách tại sân bay (người đi công tác, công vụ; người về lưu trú tại Hà Nội; người về các tỉnh khác) để bàn giao cho các lực lượng tiếp nhận theo phân công.
Thực hiện công tác truyền thông thông tin đầy đủ về điều kiện vận chuyển, yêu cầu cách ly, giám sát y tế theo quy định của thành phố và Trung ương đối với hành khách đến Hà Nội.
Sở Y tế cũng giao Trung tâm Y tế các quận, huyện, thị xã phối hợp với các đơn vị liên quan trong công tác tiếp nhận và thực hiện nhiệm vụ tại khu cách ly tập trung đối với những nơi có khu cách ly tập trung (bao gồm cả khu cách ly tập trung do quân đội, UBND các quận, huyện, thị xã quản lý và khu cách ly tại các cơ sở lưu trú du lịch).
Chỉ đạo các Trạm Y tế tham mưu cho UBND các xã, phường, thị trấn tiếp nhận và thực hiện các biện pháp cách ly tại nơi lưu trú/nhà theo đúng quy định và theo dõi sức khỏe sau cách ly theo đúng quy định.
Chỉ đạo thực hiện lấy mẫu xét nghiệm cho các đối tượng cách ly và chuyển xét nghiệm theo phân luồng xét nghiệm thường quy.