Một cán bộ cấp Vụ hoặc tương đương của Văn phòng Chính phủ làm Thư ký Phân ban. Các thành viên của Phân ban là đại diện các Bộ, cơ quan có hợp tác với Armenia. Căn cứ nội dung từng phiên họp của Ủy ban liên Chính phủ Việt Nam - Armenia, Chủ tịch Phân ban mời đại diện các Bộ, ngành, địa phương liên quan tham gia.
Việc tổ chức các hoạt động của Phân ban phù hợp với Quyết định số 30/2016/QĐ-TTg ngày 28/7/2016 của Thủ tướng Chính phủ về việc thành lập, tổ chức và hoạt động của Phân ban Việt Nam trong các Ủy ban liên Chính phủ với nước ngoài.
Thủ tướng Chính phủ giao Bộ Công Thương chủ trì, phối hợp với các Bộ, ngành liên quan của Việt Nam và phía Armenia tổ chức Khóa họp đầu tiên của Ủy ban liên Chính phủ Việt Nam và Armenia vào đầu năm 2017, tại Hà Nội.
