Đại diện Viện kiểm sát trình bày bản luận tội và đề nghị mức án. Theo đại diện Viện kiểm sát, trong thời gian từ năm 2016 đến cuối năm 2018, Sở Kế hoạch và Đầu tư Hà Nội làm chủ đầu tư thực hiện 2 gói thầu “Số hóa hồ sơ đăng ký kinh doanh trên địa bàn thành phố Hà Nội” năm 2016, 2017, tương ứng với 2 hợp đồng kinh tế được ký kết với Liên danh Nhật Cường - Đông Kinh.
Trong quá trình tổ chức, thực hiện 2 gói thầu số hóa trên, các bị cáo Nguyễn Văn Tứ, Nguyễn Tiến Học, Phạm Thị Kim Tuyến và Phạm Thị Thu Hường đã thực hiện hành vi can thiệp trái pháp luật vào hoạt động đấu thầu.
Các bị cáo Võ Việt Hùng, Lê Duy Tuấn thuộc Liên danh Nhật Cường - Đông Kinh đã thông đồng với Phạm Thị Kim Tuyến và Phạm Thị Thu Hường gian lận trong việc đưa các hợp đồng “khống” vào Hồ sơ dự thầu để chứng minh khả năng, kinh nghiệm, hợp thức hóa hồ sơ năng lực tham gia dự thầu; thiết lập các công ty làm “quân xanh” khi tham gia đấu thầu; sau khi trúng thầu đã chuyển nhượng thầu trái phép.
Viện Kiểm sát xác định hành vi vi phạm quy định về đấu thầu của các bị cáo nêu trên làm sai lệch kết quả lựa chọn nhà thầu, dẫn đến hiệu quả, mục đích, yêu cầu gói thầu không đạt được, gây thiệt hại cho Nhà nước hơn 26 tỷ đồng.
Với bị cáo Nguyễn Đức Chung, Viện kiểm sát nhận định bị cáo là Chủ tịch UBND thành phố Hà Nội đã chỉ đạo đình chỉ, dừng thực hiện gói thầu số hóa năm 2016 trái quy định của pháp luật.
Bị cáo Chung sau đó đã yêu cầu Sở Kế hoạch và Đầu tư Hà Nội lựa chọn công nghệ số hóa cơ sở dữ liệu doanh nghiệp đảm bảo tích hợp với hệ thống dùng chung của thành phố và cho Công ty Nhật Cường thí điểm số hóa để cho Công ty Nhật Cường tham gia đấu thầu và trúng thầu.
Ngoài ra, Công ty Minh Hoa (do vợ bị cáo Chung làm Giám đốc) ký kết hợp đồng khống với Công ty Nhật Cường thành lập liên danh Nhật Cường - Đông Kinh hợp thức hóa hồ sơ năng lực để dự thầu và trúng thầu.
Theo đại diện Viện kiểm sát, bị cáo Chung xâm phạm đến hoạt động đúng đắn của cơ quan Nhà nước, làm ảnh hưởng đến uy tín, hình ảnh của cơ quan công quyền trên địa bàn UBND thành phố Hà Nội.
Căn cứ vào đó, đại diện Viện Kiểm sát đề nghị Hội đồng xét xử tuyên phạt bị cáo Nguyễn Đức Chung mức án từ 3 - 4 năm tù về tội Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ quy định tại Điều 281, khoản 1 - Bộ luật Hình sự năm 1999.
Bị cáo Nguyễn Văn Tứ (cựu Giám đốc Sở Kế hoạch và Đầu tư thành phố Hà Nội) và Nguyễn Tiến Học (cựu Phó Giám đốc Sở Kế hoạch và Đầu tư thành phố Hà Nội) đều bị đề nghị mức án từ 36 - 42 tháng tù.
Các bị cáo: Phạm Thị Kim Tuyến (cựu Trưởng phòng Đăng ký kinh doanh, Sở Kế hoạch và Đầu tư thành phố Hà Nội); Võ Việt Hùng (cựu Giám đốc Công ty trách nhiệm hữu hạn đầu tư và phát triển Đông Kinh); Phạm Thị Thu Hường (cựu Chánh Văn phòng Sở Kế hoạch và Đầu tư thành phố Hà Nội) và Lê Duy Tuấn (Giám đốc kinh doanh Công ty trách nhiệm hữu hạn đầu tư và phát triển Đông Kinh) bị đề nghị từ 4 - 6 năm tù về cùng tội Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng theo quy định tại Điều 222, khoản 3 - Bộ luật Hình sự năm 2015.
Về trách nhiệm dân sự, Viện kiểm sát đề nghị buộc Công ty Đông Kinh nộp lại hơn 6 tỷ đồng thu lợi bất chính. Còn các bị cáo Nguyễn Văn Tứ, Nguyễn Tiến Học, Phạm Thị Kim Tuyến, Phạm Thị Thu Hường, Võ Việt Hùng và Lê Duy Tuấn bị đề nghị liên đới bồi thường hơn 20 tỷ đồng.
