Trong hai năm học 2017- 2018 và 2018-2019, ông Phạm Thanh Tùng có nhiều vi phạm liên quan đến tiếp nhận, quản lý một số chế độ của học sinh không đúng quy định. Ngoài ra, ông Tùng còn để vợ làm một số công việc trong cơ quan do mình phụ trách không bảo đảm quy định của Nhà nước.
Ông Tùng cũng trực tiếp và đồng thời để cấp dưới ký kết hợp đồng kinh tế cung cấp thực phẩm cho học sinh một số mặt hàng cao hơn giá thị trường. Quá trình tiếp nhận, sử dụng hàng hóa tài trợ cũng không đúng mục đích, gây thất thoát phải bồi thường.
Từ những khuyết điểm, vi phạm trên, Ủy ban Kiểm tra huyện ủy Nậm Nhùn đã quyết định thi hành kỷ luật ông Phạm Thanh Tùng, Hiệu trưởng Trường PTDTBT tiểu học Trung Chải bằng hình thức cảnh cáo.
