Giải đấu năm nay có 16 đội bóng cấp Tiểu học và 13 đội cấp THCS đến từ 24 tỉnh, thành phố trên cả nước tham dự. Ở từng trận đấu, các cầu thủ đã cống hiến nhiều pha bóng đẹp mắt với những trận đấu đầy kịch tính. Kết quả, sau 55 trận đấu có 155 bàn thắng được ghi.
Cấp Tiểu học, đội Hải Dương xuất sắc giành ngôi vô địch khi vượt qua Bắc Giang với tỷ số 2 - 0. Ở cấp THCS, sau khi Bình Định - Hà Nội cầm hòa 1 - 1 trong suốt 2 hiệp chính, các cầu thủ bước vào loạt sút penalty để phân định thắng thua. Kết quả Bình Định thắng 3 - 1 và mang về cúp vô địch.
Kết quả xếp hạng chung cuộc, tỉnh Bình Định đã trở thành đội vô địch cấp THCS, Hà Nội về nhì, đứng hạng ba là Đồng Tháp và TP Hồ Chí Minh. Ở cấp Tiểu học, tỉnh Hải Dương đoạt ngôi vô địch, Bắc Giang đứng vị trí thứ hai, hai tỉnh Lâm Đồng và Thanh Hóa xếp ở vị trí thứ ba.
Vòng chung kết Giải bóng đá Hội khỏe Phù Đổng học sinh Tiểu học và THCS toàn quốc cúp Nestlé Milo năm 2019 do Sở GD&ĐT Đồng Tháp phối hợp với Vụ Giáo dục thể chất (Bộ GD&ĐT) và UBND tỉnh Đồng Tháp tổ chức.