Theo đó, môn kiểm tra tập trung theo đề chung của Sở GD&ĐT gồm: Toán, Ngữ văn, Tiếng Anh (lớp 9); Lịch sử, Địa lý, Giáo dục công dân (lớp 10); Vật lý, Hóa học, Sinh học (lớp 11).
Đối với khối lớp 9 THCS, các môn Toán, Tiếng Anh kiểm tra theo hình thức trắc nghiệm kết hợp với tự luận (môn Toán: 30% trắc nghiệm, 70% tự luận; môn Tiếng Anh: 70% trắc nghiệm, 30% tự luận);
Khối lớp 10 và 11 THPT: môn Vật lí, Sinh học kiểm tra theo hình thức trắc nghiệm; các môn còn lại kiểm tra theo hình thức trắc nghiệm kết hợp với tự luận. Riêng trường THPT chuyên Lương Văn Chánh, môn chuyên của các lớp chuyên, trường tự ra đề kiểm tra học kì II cho các môn này theo chương trình chuyên, các môn không chuyên thực hiện kiểm tra theo đề chung của Sở.
Về thời gian, khối lớp 9 tổ chức kiểm tra tập trung trong 2 ngày (từ ngày 3 đến 4/5/2018). Với lớp 10, 11 THPT, tổ chức kiểm tra tập trung từ ngày 8 đến 9/5/2018. Nội dung kiểm tra thuộc chương trình học kì II, tính đến thời điểm kiểm tra.