Trong bộ sưu tập di sản khoa học của ông có hàng ngàn tư liệu hiện vật rất quý giá không chỉ thể hiện lịch sử cuộc đời làm khoa học của ông, mà còn góp phần vào việc nghiên cứu lịch sử khảo cổ học nói riêng và lịch sử Việt Nam nói chung.
Ngày 13-11-2021, Trung tâm Di sản các nhà khoa học Việt Nam tổ chức lễ tiếp nhận bộ sưu tập gồm hơn 1000 tài liệu, hiện vật quý, trong đó có nhiều bản thảo bài viết, bản thảo sách, giáo án và những hiện vật gắn liền với quá trình nghiên cứu khoa học, giảng dạy của ông; các mẫu tiền cổ, mẫu đá, rìu đá, bộ sưu tập xương cá, xương đầu rùa... Bộ sưu tập tài liệu hiện vật đã góp phần bổ sung tư liệu về ngành Khảo cổ học trong Bảo tàng Di sản các nhà khoa học Việt Nam.
Buổi lễ diễn ra ngay tại nhà riêng của ông, thật ấm cúng thân tình nhưng cũng rất trang trọng. Nhiều thế hệ học trò, đồng nghiệp của PGS.TS Hoàng Văn Khoán đã và đang công tác tại Cục Di sản văn hóa, ĐHQG Hà Nội, Viện Khảo cổ học, Viện KHXH và NV, Viện nghiên cứu Kinh Thành, Bảo tàng Lịch sử quốc gia, Trường ĐH Văn hóa…đã cùng đến dự, chúc mừng NGND Hoàng Văn Khoán nhân dịp Ngày nhà giáo VN, chia sẻ những tình cảm và sự ngưỡng mộ của mình dành cho một nhà giáo, nhà quản lý, nhà khoa học rất đam mê, tâm huyết, có trách nhiệm, sống nhân văn và tình nghĩa.
Trong khoa học, PGS.TS Hoàng Văn Khoán là người tiên phong nghiên cứu, ứng dụng phương pháp kim tướng học - một ngành khoa học nghiên cứu về tổ chức và cấu trúc của kim loại và hợp kim - vào khảo cổ học Việt Nam. Bên cạnh đó, ông còn có đóng góp trong lĩnh vực khảo cổ học lịch sử. quan tâm đến lĩnh vực tiền cổ, khảo cổ kiến trúc và điêu khắc. Ông cũng rất quan tâm đến các lĩnh vực thương nghiệp hay khảo cổ học thực nghiệm.
Chủ tịch nước Nguyễn Xuân Phúc đã gửi quà tặng chúc mừng PGS.TS.NGND Hoàng Văn Khoán nhân sự kiện quan trọng này.
Xin được một lần nữa trân trọng cảm ơn PGS.TS Hoàng Văn Khoán đã đóng góp những di sản khoa học quý giá của nhà khoa học lưu giữ cho thế hệ mai sau.
