Trường THPT FPT Cần Thơ trực thuộc ĐH FPT Cần Thơ, khuôn viên trường nằm trong Tổ hợp Phân hiệu Trường ĐH FPT tại Cần Thơ và Công viên phần mềm FPT Cần Thơ (đường Nguyễn Văn Cừ, phường An Bình, quận Ninh Kiều).
Theo ông Nguyễn Xuân Phong - Hiệu trưởng Trường Đại học FPT Cần Thơ: “Đây là cơ sở thứ 3 của hệ thống THPT FPT trong cả nước sau Hà Nội và Đà Nẵng. Năm 2019, cùng với sự phát triển và thành công của hệ thống giáo dục FPT tại khu vực ĐBSCL, Trường THPT FPT Cần Thơ đi vào hoạt động với mong muốn mang đến một nền giáo dục mới cho HS phổ thông tại khu vực”.
Trường hoạt động theo mô hình trường nội trú, HS học tập, sinh hoạt từ thứ hai đến thứ sáu tại trường. Bên cạnh đảm bảo chương trình phổ thông theo quy định của Bộ GD&ĐT, Trường THPT FPT còn định hướng giáo dục quốc tế; tăng cường tiếng Anh, Công nghệ thông tin và Kinh doanh; chương trình phát triển cá nhân giúp các em rèn luyện phương pháp học tập, kỹ năng, cách thức giải quyết vấn đề… giúp HS hướng tới các chương trình giáo dục đại học chuẩn quốc tế tại Việt Nam như tại ĐH FPT hoặc đi du học.
Năm học 2019 - 2020, Trường THPT FPT Cần Thơ tuyển 150 học sinh cho khối lớp 10, 11 và 12.
