Cụ thể, sau khi Bộ GD&ĐT ban hành Công văn 2787/BGDĐT-TCCB về việc không công nhận Hiệu trưởng theo đề nghị của Hội đồng trường Trường ĐH SPKT TPHCM đối với PGS.TS Nguyễn Trường Thịnh, nhà trường đã có công văn giải trình (Công văn số 35/ĐHSPKT-HĐT) các vấn đề theo yêu cầu từ Bộ GD&ĐT.
Sau khi nhận được công văn giải trình từ phía Hội đồng trường Trường ĐH SPKT TPHCM, Bộ GD&ĐT có công văn phúc đáp do Thứ trưởng Hoàng Minh Sơn ký, đề cập 3 vấn đề sau:
Yêu cầu Trường ĐH SPKT TPHCM thực hiện nghiêm Nghị quyết số 209 ngày 24/6/2021 của Ban Cán sự đảng Bộ GD&ĐT về công tác cán bộ của Trường ĐH SPKT TPHCM và công văn số 2787 ngày 6/7/2021 của Bộ GD&ĐT;
Hội đồng trường Trường ĐH SPKT TPHCM xem xét trách nhiệm của Chủ tịch Hội đồng trường trong việc ký thông báo số 07/TB-HĐT ngày 16/3/2021 không đúng với quy định, báo cáo Bộ GD&ĐT trước ngày 31/8;
Trường ĐH SPKT TPHCM cần giải quyết dứt điểm đơn thư của viên chức theo đúng quy định của pháp luật hiện hành; xem xét trách nhiệm của tập thể, cá nhân để xảy ra sai phạm (nếu có); báo cáo Bộ GD&ĐT ngay sau khi có kết quả giải quyết.
Trước đó, để chuẩn bị nhân sự thay thế cho PGS.TS Đỗ Văn Dũng về hưu, Hội đồng trường Trường ĐH SPKT TPHCM đã thực hiện quy trình nhân sự và đề nghị Bộ GD&ĐT công nhận Hiệu trưởng đối với PGS.TS Nguyễn Trường Thịnh. Tuy nhiên, Nghị quyết số 209 ngày 24/6/2021 của Ban Cán sự đảng Bộ GD&ĐT về công tác cán bộ của Trường ĐH SPKT TPHCM, Bộ GD&ĐT không công nhận ông Nguyễn Trường Thịnh làm Hiệu trưởng trường này.
Lý giải cho việc không công nhận PGS.TS Nguyễn Trường Thịnh là Hiệu trưởng Trường ĐH SPKT TPHCM, Bộ GD&ĐT ngày 6/7/2021 đã ban hành Công văn số 2787 nêu rõ: Trong phiên họp HĐT Trường ĐH SPKT TPHCM ngày 5/3/2021, HĐT có thảo luận nhưng không biểu quyết và không có nghị quyết về việc tiếp tục hay không tiếp tục giao thực hiện chức trách, nhiệm vụ, thẩm quyền chức vụ Phó Hiệu trưởng đối với TS Trương Thị Hiền.
Sau đó, Chủ tịch HĐT Ngô Văn Thuyên ký ban hành Thông báo số 07/TB-HĐT ngày 16/3/2021 (thông báo số 07/TB-HĐT) về việc không giao thực hiện chức trách, nhiệm vụ, thẩm quyền, chức vụ Phó Hiệu trưởng đối với TS Trương Thị Hiền (không căn cứ trên nghị quyết của HĐT) là không đúng với quy định tại khoản 10 điều 1 Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật Giáo dục đại học.
Việc Chủ tịch HĐT Trường ĐH SPKT TPHCM ký thông báo số 07/TB-HĐT không đúng quy định, dẫn đến việc TS Trương Thị Hiền không được tham gia với vai trò là thường vụ Đảng ủy và Phó Hiệu trưởng trong các hội nghị thực hiện quy trình hiệu trưởng; từ đó ảnh hưởng đến kết quả các bước thực hiện quy trình hiệu trưởng.