Sự việc xảy ra vào khoảng 6 giờ 20 phút ngày 20/9 tại thôn Quẽ Ngoài, xã Yên Thái. Lúc này, hai chị em Nguyễn Hà My (lớp 5) và Nguyễn Thị Vân Anh (lớp 3) trường Tiểu học Yên Thái) trên đường đi học qua đập tràn bị nước cuốn trôi. Nguyễn Hà My được người dân cứu vớt kịp thời, còn Vân Anh đã bị cũ cuốn trôi.
Sau khi nhận được tin, Ban Chỉ huy PCTT và TKCN xã Yên Thái đã chỉ đạo các lực lượng chức năng tổ chức tìm kiếm. Đến 7 giờ cùng ngày, lực lượng chức năng đã tìm thấy thi thể nạn nhân và tổ chức giao cho gia đình lo hậu sự.
Sáng cùng ngày, đoàn công tác của huyện Văn Yên và chính quyền xã đã đến thăm hỏi, động viên, hỗ trợ ban đầu cho gia đình lo hậu sự cho nạn nhân.
Trước tình hình trên, Ban chỉ huy PCTT-TKCN huyện Văn Yên đã chỉ đạo các xã kiểm tra ngầm tràn trong những ngày mưa, lũ. Đồng thời cử người cảnh báo, hỗ trợ học sinh đi qua ngập tràn an toàn, nhất là vào các khung giờ các cháu đến và rời trường.