Ở trận đấu gặp Malaysia, Văn Toàn được HLV Park Hang Seo tung vào sân khi Việt Nam bất ngờ bị gỡ hòa. Chỉ vài phút có mặt, cụ thể là ở phút 83, Văn Toàn sau khi có pha dốc bóng đã xâm nhập vòng cấm để đón đường chuyền của Vũ Văn Thanh.
Từ phía sau, hậu vệ Brendan Gan chích mũi giày trúng gót chân trái của Văn Toàn, khiến tiền đạo bên phía Việt Nam ngã ra. Trọng tài Nhật Bản Sato Ryuji lập tức chỉ tay vào chấm 11m, bất chấp phản ứng của một số cầu thủ Malaysia.
Trên chấm 11m, Quế Ngọc Hải ghi bàn ấn định chiến thắng cho đội tuyển Việt Nam. Một chiến thắng vô cùng quan trọng, giúp thầy trò HLV Park Hang Seo vững vàng ở ngôi đầu bảng, trong khi Malaysia chính thức bị loại.
Clip VNE.
Sau trận đấu, CĐV cũng như truyền thông Malaysia đều cho rằng Văn Toàn đã vờ ngã để kiếm Penalty. Trang cá nhân của tiền đạo biên chế HAGL bị “tấn công” bằng những lời lẽ rất nặng nề. Nhiều bài báo ở Malaysia cũng cáo buộc Văn Toàn ăn vạ.
Còi vàng V.League 2006 Dương Mạnh Hùng cho rằng: "Nhìn qua ti vi thì không dễ để thấy rõ cầu thủ số 15 có động tác phạm lỗi hay không. Tuy nhiên, trọng tài chính người Nhật có góc nhìn tốt, vị trí quan sát rất gần sẽ đưa ra quyết định chuẩn nhất, còn mình quan sát qua ti vi nhiều khi góc máy không đủ để đánh giá".
"Theo luật, bóng đang ở trong tầm kiểm soát mà cầu thủ khác lại có tác động ngăn cản việc chơi bóng của Văn Toàn thì đương nhiên phải thổi penalty rồi. Chỉ có điều vấn đề gây tranh cãi lại là Văn Toàn khi bị đạp vào gót lại không ngã ngay. Cậu ấy rướn thêm một nhịp nên vị trí ngã và vị trí va chạm hơi xa nhau. Đó chính là nguyên nhân gây tranh cãi".
Trong khi đó, Văn Toàn cho biết, thật sự là anh bị phạm lỗi. Do góc quay không rõ nên Văn Toàn đã bị oan. Chỉ mới đây, khi xuất hiện đoạn clip do một khán giả ngồi trên khán đài quay lại, tiền đạo Việt Nam mới thật sự được minh oan.
ĐT Việt Nam hiện đang dẫn đầu với 17 điểm, hơn UAE 2 điểm. Ở trận đấu cuối cùng bảng G gặp UAE vào ngày 15-6 tới, nếu có ít nhất 1 điểm, tuyển Việt Nam sẽ chắc chắn giành ngôi đầu bảng cùng tấm vé trực tiếp vào vòng loại cuối cùng.