Theo đó, đối với học sinh từ tỉnh khác xin chuyển về học tại các trường trong địa bàn tỉnh và học sinh từ các huyện, thị xã trong tỉnh xin chuyển trường về học ở các trường công lập trên địa bàn thành phố Tuy Hòa phải có ý kiến đồng ý của Sở GD&ĐT trước khi tiếp nhận.
Đối với học sinh xin chuyển giữa các trường trong tỉnh (ngoài địa bàn thành phố Tuy Hòa: Hiệu trưởng các trường tự giải quyết theo quy định tại Quyết định số 51/2002/QĐ-BGDĐT và dự trên nguyên tắc đảm bảo sĩ số học sinh trên lớp theo quy định của Điều lệ trường trung học.
Học sinh đang học ở các trường ngoài công lập và hệ giáo dục thường xuyên không được chuyển đến các trường công lập, trừ những trường hợp đặc biệt do Giám đốc Sở cho phép.
Mỗi năm học, Phú Yên sẽ có 2 đợt giải quyết chuyển trường cho học sinh. Đợt 1 từ 1/7 đến 4/9 và đợt 2 từ 15/1 đến 31/1.
Trường hợp đặc biệt, ngoài thời gian quy định trên sẽ do Sở GD&ĐT quyết định.
