Việc thành lập Kiểm ngư tỉnh Thanh Hoá nhằm nâng cao hiệu quả, hiệu lực trong thực hiện nhiệm vụ tuần tra, kiểm tra, kiểm soát, thanh tra, xử lý các hành vi vi phạm trong hoạt động khai thác thuỷ, hải sản trên vùng biển, vùng nước nội địa thuộc phạm vi quản lý và trên địa bàn tỉnh.
Tổng số biên chế và lao động hợp đồng được bố trí cho Kiểm ngư tỉnh Thanh Hoá là 29 người.
Giai đoạn 2025 - 2030, UBND tỉnh Thanh Hoá xem xét, quyết định đầu tư cơ sở vật chất, văn phòng làm việc, phương tiện, trang thiết bị làm việc cho Kiểm ngư tỉnh Thanh Hoá để đáp ứng yêu cầu thực hiện nhiệm vụ.
Kiểm ngư tỉnh Thanh Hoá chịu sự chỉ đạo, quản lý của Chi cục Thuỷ sản; chịu sự hướng dẫn, kiểm tra về chuyên môn, nghiệp vụ liên quan đến nhiệm vụ kiểm ngư của Cục Kiểm ngư thuộc Bộ NN&PTNT.
Các Trạm Kiểm ngư được cấp con dấu để phối hợp hoạt động với cơ quan liên quan trên địa bàn tỉnh theo quy định.
Năm 2023, UBND tỉnh Thanh Hoá thành lập Kiểm ngư tỉnh Thanh Hoá trên cơ sở sắp xếp, tổ chức lại các phòng ban, trạm thuộc Chi cục Thuỷ sản trực thuộc Sở NN&PTNT.
Việc thành lập đơn vị mới này còn nhằm đáp ứng yêu cầu thực hiện nhiệm vụ theo quy định của Luật Thuỷ sản 2017, các quy định của pháp luật có liên quan trong lĩnh vực thuỷ sản; nhằm chống khai thác hải sản bất hợp pháp, bảo vệ nguồn lợi thuỷ sản, góp phần phát triển thuỷ sản bền vững và bảo vệ chủ quyền quốc gia trên biển.
Theo lộ trình, đến năm 2030, tỉnh Thanh Hóa sẽ tăng cường lực lượng Kiểm ngư mạnh về nhân lực, trang thiết bị và phương tiện hoạt động.