Theo các nhà phân tích, chiếc radar này không thể theo dõi các mục tiêu ẩn trên không, ví dụ như những máy bay chiến đấu tàng hình.
Đã có ý kiến cho rằng, hệ thống tên lửa phòng không S-400 của Nga chỉ có thể chống lại máy bay chiến đấu thế hệ 4 vì radar tần số thấp không thể phát hiện máy bay chiến đấu thế hệ 5 ở khoảng cách lớn. Điều này khiến S-400 có thể bị tiếp cận và vô hiệu hóa.
Theo báo cáo của Hải quân và Không quân Mỹ, nếu tín hiệu tàng hình của máy bay phát ra bất thường thì các radar của S-400 sẽ khó có thể phát hiện ra chúng.
Hiện tại, máy bay chiến đấu F-22 và F-35 hoạt động khá hiệu quả trong việc chống lại các hệ thống phòng không của Nga. Tuy nhiên, Mỹ lo ngại rằng theo thời gian, Nga và Trung Quốc sẽ phát triển một thuật toán để tiêu diệt các máy bay chiến đấu này.