Đối với hệ đại trà, nhà trường thu học phí theo lộ trình quy định tại Điều 11 Nghị định 81/2021/NĐ-CP ngày 27/8/2021 của Chính phủ. Cụ thể, ngành dược học áp dụng mức thu học phí là 2.450.000đ/tháng (24.500.000đ/năm học).
Ngành Hóa dược mức học phí là 1.850.000đ/tháng (18.500.000đ/năm học).
Ngành công nghệ sinh học và ngành hóa học áp dụng mức học phí là 1.350.000đ/tháng (13.500.000đ/năm học).
Đối với hệ chất lượng cao, học phí năm học tới là 4.950đ/tháng (49.500.000đ/năm học).
Theo Đề án tuyển sinh năm 2023, Trường ĐH Dược Hà Nội sử dụng các phương thức xét tuyển gồm:
Phương thức 1: Xét tuyển thẳng theo quy định về tuyển thẳng của Bộ GD&ĐT và Nhà trường.
Phương thức 2: Xét tuyển kết hợp kết quả học tập THPT với chứng chỉ SAT/ACT Thí sinh đạt học lực giỏi 3 năm, kết quả học tập THPT từng năm học của mỗi môn thuộc tổ hợp xét tuyển không dưới 8,0; THPT niên khóa 2020-2023
| STT | Chứng chỉ quốc tế | Ngành Dược học | Ngành khác |
| 1 | SAT | 1350 | 1300 |
| 2 | ACT | 30 | 27 |
Trường này không áp dụng đối với thí sinh là học sinh các cơ sở giáo dục thường xuyên.
Phương thức 3: Xét tuyển căn cứ kết quả Kỳ thi đánh giá tư duy của Trường Đại học Bách Khoa Hà Nội năm 2023. Yêu cầu tổng điểm bài thi tư duy đạt từ 80 điểm trở lên.
Đối với ngành Dược học, thí sinh đăng ký xét tuyển có kết quả học tập THPT từng năm học của mỗi môn Toán, Vật lý, Hóa học không dưới 7,0 và có học lực lớp 12 xếp loại giỏi trở lên.
Đối với ngành Hóa dược, thí sinh đăng ký xét tuyển có kết quả học tập THPT từng năm học của mỗi môn Toán, Vật lý, Hóa học không dưới 7,0.
Phương thức 4: Xét tuyển căn cứ kết quả thi tốt nghiệp THPT năm 2023.
Đối với ngành Dược học và Hóa dược, thí sinh đăng ký xét tuyển có kết quả học tập THPT từng năm học của mỗi môn Toán, Vật lý, Hóa học không dưới 7,0.
