Thổ Châu là đặc khu xa nhất của tỉnh An Giang, với tổng diện tích 13,98km2, cách xa Phú Quốc khoảng 110km và TP Rạch Giá (cũ) khoảng 220km. Thổ Châu có vị trí chiến lược về quốc phòng, an ninh quan trọng, nằm trong khu vực phòng thủ của tỉnh, Quân khu 9 và cả nước.