Theo quyết định, Trường THPT Nghĩa Trụ có địa điểm tại tại xã Nghĩa Trụ là cơ sở giáo dục thuộc hệ thống giáo dục quốc dân, chịu sự quản lý nhà nước của Sở Giáo dục và Đào tạo Hưng Yên.
Trường có tư cách pháp nhân, có con dấu và được mở tài khoản riêng; được giao tự chủ về tổ chức bộ máy, nhân sự, tài chính và cơ sở vật chất theo quy định của pháp luật.
Về nhiệm vụ, quyền hạn, tổ chức, hoạt động, Trường THPT Nghĩa Trụ thực hiện theo Thông tư số 15/2026/TT-BGDĐT của Bộ GD&ĐT ban hành Điều lệ trường tiểu học, trường trung học cơ sở, trường trung học phổ thông, trường phổ thông có nhiều cấp học; các quy định hiện hành của Nhà nước và của tỉnh Hưng Yên có liên quan.
UBND tỉnh Hưng Yên giao Sở GD&ĐT chỉ đạo trường Trung học phổ thông Nghĩa Trụ thực hiện thủ tục để được cho phép hoạt động giáo dục trước khi tuyển sinh và tổ chức dạy học đảm bảo các quy định hiện hành.
